Kaoru es un chico de secundaria que vive en un pequeño pueblo en el interior de Japón. Cierto día, escucha por casualidad una leyenda urbana que habla de cierto túnel que tiene la capacidad de cumplirle un deseo a cualquiera que lo atraviese a cambio de quitarle años de vida.

Mientras camina en una calurosa noche de verano, el chico se topa con un misterioso pasaje que desprende una energía particular y, con la ilusión de poder recuperar a su pequeña hermana desaparecida, decide cruzarlo. Tras asustarse de las extrañas cosas que estaban pasando en el interior del lugar, Kaoru escapa y vuelve a su casa, sólo para descubrir que estuvo fuera por una semana completa.

Días después, el chico decide intentar adentrarse en el túnel nuevamente, pero cuando está por hacerlo se da cuenta que no está solo. Anzu Hanaki, una nueva compañera de curso que está teniendo muchos problemas para adaptarse, lo siguió y se ofrece a acompañarlo para que juntos puedan descubrir la verdad detrás del Túnel Urashima.